食用菌精准育种实验室
Laboratory of Mushroom Precision Breeding


首个猪肚菇基因组信息在Frontiers in Microbiology发表




猪肚菇(Pleurotus giganteus),又名大杯蕈大杯伞、大漏斗菌是一种味道鲜美的珍稀食用菌(图1)。猪肚菇凭借竹笋般的清脆,又被称为笋菇,凭借独特口感,深受广大食客的青睐。研究显示,猪肚菇的蛋白质含量与金针菇等菌菇相似,其菌盖中氨基酸含量为干物质的17%左右,其中8种人体必需氨基酸占氨基酸总量的45%,较一般食用菌要高猪肚菇多糖具有抗肿瘤、抗氧化、增强免疫力等多种功效。猪肚菇属于高温菌株,非常适合与其他的中低温菌株进行套种,弥补夏季食用菌品种缺乏的现状。目前上海市农业科学院食用菌研究所已经成功驯化了适合工厂化栽培的猪肚菇新品种,并且完成了猪肚菇的DUS测试指南。

1 猪肚菇子实体和单双核菌丝纤维照片

 

近期上海市农业科学院食用菌研究所和青岛农业大学食用菌精准育种实验室联合在Frontiers in Microbiology发表论文Whole-genome sequence of a high-temperature edible mushroom Pleurotus giganteus (zhudugu),详细公布了猪肚菇基因组精细图谱、高质量基因组数据和基因功能注释结果(图2)。

 

2 猪肚菇基因组论文

 

猪肚菇基因组大小为40.00 Mb,共含有27contigscontig N50大小为4.384 Mb(图3)。通过进化分析明确了猪肚菇属于侧耳属的真菌,与虎奶菇(Pleurotus tuber-regium)的亲缘关系较近(图4)。通过de novo比对在猪肚菇的基因组中共鉴定到了12628个基因。其中鉴定到了418个漆酶,包括了15个漆酶和10class II过氧化物酶,这表明了猪肚菇具有较强的木质纤维素转化和利用的能力。此外本研究还分析了猪肚菇的交配型基因mating Amating B,为后续基于交配型基因的杂交育种分子标记开发提供了重要参考(图4)。

3 猪肚菇基因组图谱

 

这是国际上首次公布猪肚菇基因组图谱,为猪肚菇的基础研究和遗传育种奠定了坚实的基础。国家食用菌技术体系岗位科学家上海市农科院于海龙副研究员、上海市农业科学院张美彦、上海市农业科学院孙雅婷为并列第一作者,上海市农业科学院章炉军副研究员和青岛农业大学于浩副教授为共同通讯作者。

 

4 猪肚菇比较基因组信息和交配型基因信息。

 

猪肚菇高质量基因组下载渠道:

ftp://www.mushroomlab.cn/

论文连接:

https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fmicb.2022.941889/full

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